Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrnb2Q9ERK7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.5 ms