Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
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Pdzd9Q9D9M4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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Pdzd9Q9D9M4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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Pdzd9Q9D9M4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Pdzd9Q9D9M4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Pdzd9Q9D9M4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Pdzd9Q9D9M4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdzd9Q9D9M4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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