Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D3J9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D3J9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms