Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed11Q9D2R4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed11Q9D2R4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms