Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lsm12Q9D0R8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm12Q9D0R8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms