Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf146Q9CZW6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf146Q9CZW6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms