Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Khdc3Q9CWU5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Khdc3Q9CWU5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms