Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930553M12RikQ9CUH1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930553M12RikQ9CUH1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms