Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmd9Q9CR00 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms