Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mri1Q9CQT1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mri1Q9CQT1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms