Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DenrQ9CQJ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DenrQ9CQJ6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms