Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms