Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb3bpQ9CQ82 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms