Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ska1Q9CPV1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms