Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp1b1Q99LU0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms