Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf34Q99KR6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf34Q99KR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms