Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Thumpd1Q99J36 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Thumpd1Q99J36 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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