Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirt1Q923E4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirt1Q923E4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms