Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpe65Q91ZQ5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpe65Q91ZQ5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms