Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Pde6cQ91ZQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde6cQ91ZQ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Pde6cQ91ZQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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