Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hdac11Q91WA3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac11Q91WA3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hdac11Q91WA3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms