Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8VDP2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8VDP2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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