Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC82

Rhbdl1, Rhomboid-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl1Q8VC82 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl1Q8VC82 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhbdl1Q8VC82 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms