Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc12Q8R344 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc12Q8R344 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms