Protein–RNA interactions for Protein: Q8R317

Ubqln1, Ubiquilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln1Q8R317 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubqln1Q8R317 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubqln1Q8R317 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln1Q8R317 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln1Q8R317 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln1Q8R317 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubqln1Q8R317 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln1Q8R317 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln1Q8R317 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubqln1Q8R317 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ubqln1Q8R317 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms