Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r200Q8R281 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Vmn1r200Q8R281 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r200Q8R281 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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