Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc5Q8K4Z2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc5Q8K4Z2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms