Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Otud6bQ8K2H2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms