Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brd3Q8K2F0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brd3Q8K2F0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms