Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prkd3Q8K1Y2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms