Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Stx5Q8K1E0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Stx5Q8K1E0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms