Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp37Q8C0R0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp37Q8C0R0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms