Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpc2Q8BKV1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms