Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms