Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg4dQ8BGV9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms