Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
H2-M10.4Q85ZW8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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