Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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H2-M10.5Q85ZW7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms