Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srgap3Q812A2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srgap3Q812A2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms