Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms