Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Syne2Q6ZWQ0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms