Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl3Q6W5C0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms