Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Szrd1Q6NXN1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms