Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cep290Q6A078 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cep290Q6A078 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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