Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmcc1Q69ZZ6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmcc1Q69ZZ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms