Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp4Q68FH0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms