Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna3Q65CL1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms