Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Kdm5dQ62240 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Kdm5dQ62240 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms