Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxd3Q61060 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms