Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf3Q60803 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Traf3Q60803 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms