Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd4Q60688 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms